modifié le 21 mars 2020
Origines du coronavirus actuel ?
site du Museum d’Histoire Naturelle de Paris : une double origine ?
Son génome est sous la forme d’une molécule d’ARN. C’est un virus à ARN.
Le séquençage a permis de le comparer aux génomes des autres coronavirus déjà connus.
Le génome typique du coronavirus (CoV) est un génome à ARN monocaténaire non segmenté, qui est d’environ 26 à 32 kb. Il contient des coiffes méthylées en 5ʹ et des queues polyadénylées en 3ʹ.
Il est organisé à partir de l’extrémité de 5ʹ avec :
- des gènes (RdRp, Hel),
L’ARN polymérase ARN dépendante (RdRp) et l’hélicase (Hel) sont des enzymes importantes impliquées dans la transcription et la réplication des CoV.
- des gènes codant pour des protéines structurales (glycoprotéine de pointe (S), protéine d’enveloppe (E), protéine de membrane (M) et protéine de nucléocapside (N )),
Le tiers du génome code les protéines structurales (S, E, M et N), qui sont essentielles pour la liaison virus-cellule-récepteur et l’assemblage virion, et d’autres protéines non structurales et protéines accessoires qui peuvent avoir des effets immunomodulateurs.
- queue polyadénylée puis extrémité 3ʹ.
Plusieurs pistes sont exploitées à la recherche d’un traitement médical :
- l’utilisation d’un système CRISPR-Cas13 qui cible l’ORF1ab et le gène S pour bloquer l’expression de la réplicase, de la transcriptase et de la protéine S.
- des molécules médicaments antiviraux qui sont efficaces sur le VIH (c’est aussi un virus à ARN), ebola comme les inhibiteurs de la transcriptase inverse.
- anticorps prélevés sur les patients atteints du coronavirus soignés puis injectés à des malades pour avoir une réponse immunitaire plus efficace.
- étude in vitro de la chloroquine
Sources bibliographiques :
Virus against virus: a potential treatment for 2019-nCov (SARS-CoV-2) and other RNA virusesTuan M. Nguyen, Yang Zhang & Pier Paolo Pandolfi ; Cell Research volume 30, pages 189–190(2020, februar 18)
Progression, recherche sur les traitements, mortalité : le point sur l’épidémie de coronavirus, par Eric D’Ortenzio (article paru sur The Conversation le 28 février 2020)